农村合作社在进行财务管理时，通常会选择一套适用的财务管理软件。最常用的财务管理软件是中小企业财务管理软件，它能够完成多种财务处理工作。
在开始财务管理之前，首先需要确定账户类型，例如资产账户、负债账户、权益账户等。其次，根据不同的收入和支出进行分类，例如将收入分为营业收入、政府补贴等，将支出分为办公费用、固定资产折旧等。最后，将各类账户数据录入到财务管理软件中，便可以系统地管理财务工作。
同时，还需要定期对账户进行核对，并根据实际情况时刻跟踪财务状况，对账务进行把关，从而确保财务的准确性和完整性。
拓展知识：农村合作社在做账的同时，也要遵循国家财务会计准则，保证账务的真实、准确、合法、有效。这样可以准确了解财务状况，及时制定合理的财务处理措施，有助于提高经营效益。