交附加税的会计分录应当清楚地说明支付的附加税的用途及缴纳的部门。可以使用四个会计分录，即借：应交税费、贷：银行存款（或现金）；借：现金（或银行存款）、贷：应交税费；借：存出保证金缴税、贷：应交税费；借：应交税费、贷：其他应付款。如果附加税被转移至其他部门，那么可以使用两个会计分录，即借：应交税费、贷：其他应付款；借：其他应付款、贷：应交税费。
在做会计分录时，一定要记得要把附加税的记账凭证和实付凭证等一并备份，以便以后稽核审计使用。另外，还要详细记录每一次税费缴纳的情况，记录应缴税费金额，实际缴税日期，及缴款凭证等，以备查验使用。
拓展知识：
附加税又称特许税或辅助税，是国家对居民和企业营利所征收的一种特殊税种，是国家对营利行为实行限制、整顿和监管的利器。附加税按税种可以分为资源税、城市维护建设税、教育费附加税、城市综合维护建设税等。按照缴纳部门分，可以分为地方附加税、国家附加税等。