有编制和没有编制的区别在于组织结构。有编制的组织结构受到明确的编制规定，按部就班，由明确的职权和职责等等，当事人可以依据职权规定行使其权力，并且责任也是有权有责的。
而没有编制的组织结构则不受这样的约束，当事人可以按照自己的意愿行事，责任也是分散的，一般不存在直接的责任制。因此，有编制的组织可以更有效地把控组织的运作，实现管理的目标，而没有编制的组织则比较容易出现秩序混乱、无法有效控制组织活动等问题。
拓展知识：有编制的组织可以根据不同的工作性质和组织职能，划分出不同的等级，为每个等级制定不同的职权和职责，并保证每一层级和每一职位之间的权责分工，从而确保组织内部的有序运行，同时还可以有效的审核正确的执行下属的工作内容，避免重复劳动。