政府会计的做账流程包括国库集中支付业务。其中，财政直接支付业务在收到“财政直接支付入账通知书”时，预算会计借：行政支出/事业支出，贷：财政拨款预算收入；财务会计借：库存物品/固定资产/应付职工薪酬/业务活动费用/单位管理费用，贷：财政拨款收入。年末，预算会计借：资金结存—财政应返还额度，贷：财政拨款预算收入；财务会计借：财政应返还额度—财政直接支付，贷：财政拨款收入。
下年度恢复财政直接支付额度后，单位以财政直接支付方式发生实际支出。预算会计借：行政支出/事业支出，贷：资金结存—财政应返还额度；财务会计借：库存物品/固定资产/应付职工薪酬/业务活动费用/单位管理费用，贷：财政应返还额度—财政直接支付。