在处理企业运费时，有几种不同的会计处理方法。首先，如果运费是企业自身产生的，那么这部分费用应并入材料成本中。具体来说，会计分录如下：原材料借方增加，应交税费-应交增值税-进项税贷方增加，银行存款等贷方减少。
其次，如果是代付运费的情况，那么会计处理方式会有所不同。在这种情况下，会计分录为：应收账款/其他应收款借方增加，银行存款等贷方减少。当收到款项时，会计分录为：银行存款等借方增加，应收账款/其他应收款贷方减少。
最后，如果企业为对方提供搬运服务并收取费用，那么这部分收入应计入主营业务收入或其他业务收入。具体的会计分录为：应收账款借方增加，主营业务收入或其他业务收入贷方增加，应交税费-应交增值税-销项税贷方增加。
总的来说，企业在处理运费时，需要根据具体情况选择合适的会计处理方法，以确保财务记录的准确性和合规性。