劳务派遣的计税方式主要有三种。首先，一般纳税人提供劳务派遣服务时，可以选择按照财税〔2016〕36号文件的规定，以取得的全部价款和价外费用为销售额，并按6%的税率采用一般计税方法缴纳增值税。此外，也可以选择差额纳税的方式，即以取得的全部价款和价外费用，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利以及为其办理社会保险及住房公积金后的余额为销售额，然后按照简易计税方法依5%的征收率缴纳增值税。
其次，对于小规模纳税人提供劳务派遣服务的情况，同样可以按照财税〔2016〕36号文件的规定，以取得的全部价款和价外费用为销售额，并按3%的征收率采用简易计税方法缴纳增值税。此外，也可以选择差额纳税的方式，以取得的全部价款和价外费用，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利以及为其办理社会保险及住房公积金后的余额为销售额，然后按照简易计税方法依5%的征收率计算缴纳增值税。
最后，需要注意的是，选择差额纳税的纳税人在向用工单位收取用于支付给劳务派遣员工工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金的费用时，不得开具增值税专用发票，但可以开具普通发票。
补充说明一下，劳务派遣是指劳务派遣单位与被派遣劳动者建立劳动关系，并将劳动者派遣到用工单位从事劳动的一种新型用工形式。在这种形式下，被派遣劳动者在用工单位的指挥和监督下工作。