会计档案销毁清册应永久保存，无论是在企业和其他组织的会计档案保管期限中，还是在财政总预算、行政单位、事业单位和税收会计档案保管期限中。
会计档案销毁规定如下： 1. 当会计档案保管期满需要销毁时，应由本单位档案机构会同会计机构共同提出销毁意见，并与财务会计部门共同鉴定和严格审查，然后编制会计档案销毁清册。 2. 对于机关、团体、事业单位和非国有企业的会计档案要销毁时，需报经本单位领导批准后方可销毁；而国有企业则需要经企业领导审查，并报请上级主管单位批准后方可销毁。 3. 若会计档案保管期满，但其中存在未了结的债权债务的原始凭证，则应单独抽出，另行立卷，并由档案部门保管直至债权债务结清为止；同时，建设单位在建设期间的会计档案不得销毁。 4. 在销毁档案之前，应按会计档案销毁清册所列的项目逐一清查核对。各单位销毁会计档案时应由档案部门和财会部门共同派员监销；各级主管部门销毁会计档案时，应由同级财政部门、审计部门派员参加监销；财务部门销毁会计档案时，应由同级审计部门派员才加监销。 5. 会计档案销毁后，经办人应在“销毁清册”上签章，并注明“已销毁”字样和销毁日期，以示负责。同时，还需将监销情况写出书面报告一式两份，一份报本单位领导，一份归入档案备查。