扣减进项税额的方式有两种：
1. 知道原进项税额的情况：直接转出。 2. 不知道原进项税额的情况：通过转出应税货物、劳务或服务的成本确定进项税额。
具体计算方法如下： - 材料应转出进项税额 = 材料成本 × 13%。 - 运费应转出进项税额 = 运费成本 × 9%。 - 农产品应转出进项税额 = 农产品成本 ÷ (1 - 9%) × 9%。
进项税额是指纳税人购进货物、加工修理修配劳务、服务、无形资产或者不动产时，支付或者负担的增值税额。