根据规定，已经报税的普票发票开具已经跨月了，不能作废，应该次月开具红字发票。登陆“防伪税控开票软件”之后，点击软件上方“红字发票管理”，在下拉菜单中，选择“增值税普票红字信息表填开”，输入发票代码、发票号码，点击进行下一步；进入“红字发票信息表”界面，在右下角的“申请理由”中输入需要开具红字发票的原因，确定无误，再点击操作界面上方的上传，等系统提示已经审核成功后，可直接开具红字发票了。
首先，我们需要了解的是，如果已经报税的普票发票开具已经跨月了，那么就不能作废了。这是因为根据规定，跨月的发票是不能作废的，只能通过次月开具红字发票来处理。
接下来，我们需要登录到“防伪税控开票软件”中进行处理。在软件的上方，我们可以看到一个“红字发票管理”的选项，点击它后，会出现一个下拉菜单。在这个菜单中，我们需要选择“增值税普票红字信息表填开”这个选项。
然后，我们需要输入发票代码和发票号码，这是为了确定我们要处理的是哪一张发票。输入完成后，点击进行下一步。
接下来，我们会进入到“红字发票信息表”的界面。在这个界面的右下角，有一个“申请理由”的输入框。在这里，我们需要输入为什么需要开具红字发票的原因。这个原因一定要真实准确，否则可能会影响后续的处理。
确定无误后，我们需要点击操作界面上方的“上传”按钮。等待系统提示已经审核成功后，我们就可以直接开具红字发票了。
总的来说，处理已经跨月的普票发票需要按照一定的步骤来进行。首先，我们需要了解相关规定；然后，我们需要登录到“防伪税控开票软件”中进行操作；接着，我们需要输入相关的信息并上传；最后，我们就可以开具红字发票了。这个过程虽然有些复杂，但是只要我们按照步骤来，就可以顺利完成。