在增值税体系中，一般纳税人和小规模纳税人在销售水杯时适用不同的税率。具体而言，一般纳税人销售水杯时，其增值税专用发票的税率为13%，而小规模纳税人则为3%。增值税是一种以商品或应税劳务在流转过程中产生的增值额作为计税依据的流转税。我国现行的增值税制度采用了比例税率，根据不同的应税行为分为三档税率：13%、9%和6%，以及两档征收率：5%和3%。