个人所得税扣税基数是5000，个人所得税税前扣除项目有：个人承担的三险一金、专项附加扣除、公益性捐赠、年金、商业健康保险。专项附加扣除包括：子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出。