员工住院的医疗费，如果是属于工伤，公司应该支付的部分，计入到管理费用—劳保费或者福利费科目，具体的分录如下：

借：管理费用—福利费等，

贷：应付职工薪酬—工伤补贴等。

直接支付的时候，

借：应付职工薪酬，

贷：银行存款等。

如果是员工自己应该负担的，则公司不用入账，由员工自己支付就可以了。