专项扣除只是在个税前减少了应纳税所得额，不需要对专项扣除单独记账。正常做计提及发放工资的分录就可以了。

借：管理费用-工资等，

贷：应付职工薪酬。

发放工资的时候：

借：应付职工薪酬，

贷：银行存款 应交税费-应交个人所得税。

缴纳个税的时候：

借：应交税费-应交个人所得税，

贷：银行存款等。